MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60501	NC_015850	CAC	2	6	2921968	2921973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783613
60502	NC_015850	GCA	2	6	2921975	2921980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783613
60503	NC_015850	GCT	2	6	2921994	2921999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783613
60504	NC_015850	CCT	2	6	2922024	2922029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783613
60505	NC_015850	GCC	2	6	2922045	2922050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783613
60506	NC_015850	CA	3	6	2922102	2922107	50 %	0 %	0 %	50 %	340783613
60507	NC_015850	CGC	2	6	2922181	2922186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783613
60508	NC_015850	CAC	2	6	2922235	2922240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783613
60509	NC_015850	CGCC	2	8	2922251	2922258	0 %	0 %	25 %	75 %	340783613
60510	NC_015850	GCC	3	9	2922256	2922264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783613
60511	NC_015850	GCC	2	6	2922269	2922274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783613
60512	NC_015850	GGC	2	6	2922394	2922399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783613
60513	NC_015850	CGG	3	9	2922540	2922548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783613
60514	NC_015850	CGG	2	6	2922555	2922560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783613
60515	NC_015850	TCG	2	6	2922611	2922616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783613
60516	NC_015850	GC	3	6	2922692	2922697	0 %	0 %	50 %	50 %	340783613
60517	NC_015850	CGC	2	6	2922717	2922722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783613
60518	NC_015850	GAT	2	6	2922767	2922772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783614
60519	NC_015850	CCA	2	6	2922811	2922816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783614
60520	NC_015850	GAT	2	6	2922878	2922883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783614
60521	NC_015850	GGCG	2	8	2923028	2923035	0 %	0 %	75 %	25 %	340783614
60522	NC_015850	CCG	2	6	2923039	2923044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783614
60523	NC_015850	CAT	2	6	2923067	2923072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783614
60524	NC_015850	ACC	2	6	2923073	2923078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783614
60525	NC_015850	CCA	2	6	2923177	2923182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783614
60526	NC_015850	TCG	2	6	2923191	2923196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783614
60527	NC_015850	TGAAT	2	10	2923234	2923243	40 %	40 %	20 %	0 %	340783614
60528	NC_015850	TTCC	2	8	2923251	2923258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60529	NC_015850	CCAGGG	2	12	2923322	2923333	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783615
60530	NC_015850	TGA	2	6	2923358	2923363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783615
60531	NC_015850	CGG	2	6	2923396	2923401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783615
60532	NC_015850	CG	4	8	2923409	2923416	0 %	0 %	50 %	50 %	340783615
60533	NC_015850	CCG	2	6	2923457	2923462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783615
60534	NC_015850	GGC	2	6	2923500	2923505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783615
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60537	NC_015850	CCTCGG	2	12	2923613	2923624	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783615
60538	NC_015850	TCGT	2	8	2923655	2923662	0 %	50 %	25 %	25 %	340783615
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60540	NC_015850	GGCGG	2	10	2923800	2923809	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
60541	NC_015850	ACCC	2	8	2923881	2923888	25 %	0 %	0 %	75 %	340783616
60542	NC_015850	CCA	2	6	2924006	2924011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783616
60543	NC_015850	CG	3	6	2924057	2924062	0 %	0 %	50 %	50 %	340783616
60544	NC_015850	GC	3	6	2924145	2924150	0 %	0 %	50 %	50 %	340783616
60545	NC_015850	CTC	2	6	2924157	2924162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783616
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60548	NC_015850	TGA	2	6	2924408	2924413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783616
60549	NC_015850	AGA	2	6	2924442	2924447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60550	NC_015850	TGGT	2	8	2924467	2924474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60551	NC_015850	GTC	2	6	2924512	2924517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60552	NC_015850	ATA	2	6	2924548	2924553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60553	NC_015850	TAT	2	6	2924560	2924565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60554	NC_015850	AATA	2	8	2924580	2924587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60555	NC_015850	G	6	6	2924707	2924712	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60556	NC_015850	GGA	2	6	2924725	2924730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60557	NC_015850	A	6	6	2924765	2924770	100 %	0 %	0 %	0 %	340783617
60558	NC_015850	ACA	2	6	2924865	2924870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783617
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60569	NC_015850	CAT	2	6	2925283	2925288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783617
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60581	NC_015850	TTTA	2	8	2926176	2926183	25 %	75 %	0 %	0 %	340783617
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60584	NC_015850	CGA	2	6	2926272	2926277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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60587	NC_015850	GAT	2	6	2926502	2926507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60588	NC_015850	GC	3	6	2926518	2926523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60589	NC_015850	GGC	2	6	2926572	2926577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60590	NC_015850	GGGC	2	8	2926583	2926590	0 %	0 %	75 %	25 %	340783618
60591	NC_015850	GGC	2	6	2926616	2926621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783618
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60607	NC_015850	CTC	2	6	2927307	2927312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60608	NC_015850	TCG	2	6	2927385	2927390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783620
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60614	NC_015850	CGGCA	2	10	2927552	2927561	20 %	0 %	40 %	40 %	340783620
60615	NC_015850	GGCG	2	8	2927638	2927645	0 %	0 %	75 %	25 %	340783620
60616	NC_015850	GCT	2	6	2927656	2927661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783620
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60718	NC_015850	GC	3	6	2932027	2932032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60719	NC_015850	GGGT	2	8	2932113	2932120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60720	NC_015850	C	6	6	2932166	2932171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60721	NC_015850	CGCGC	2	10	2932173	2932182	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60722	NC_015850	CGGGGT	2	12	2932191	2932202	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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